logicsegment.cpp: Suggest inlining of pack_sample()/unpack_sample().

These functions were not inlined by default (tested with gcc 7.3.0).
They're in a hot code path, so inlining can help with performance here.

logicsegment.cpp: Add missing config.h #include.

Without this #include, HAVE_UNALIGNED_LITTLE_ENDIAN_ACCESS was not
available and thus the faster path in LogicSegment::unpack_sample() and
LogicSegment::pack_sample() was never used.

DecodeSignal: avoid specifying a zero samplerate to libsigrokdecode

When the sample rate is not known, avoid claiming the value would be
zero and calling setup routines in backend libraries. Although the call
is not strictly fatal, this simple check avoids potential log messages
at callee's for this unexpected condition.

session: apply input format match to interactively loaded files, too

Move the format match logic from load_init_file() to load_file(), so
that it transparently takes effect on each "opened" file. Users still
can choose to "import" files and specify options when required. In the
case of lookup miss, sigrok session is assumed as before.

This fixes the remainder of bug #1015.

session: add support to auto detect input format (for init file)

Extend the Session::load_init_file() method, to have the input format
automatically detected in the absence of an -I spec upon startup.

This fixes part of bug 1015. Input files specified at the command line
when pulseview gets invoked are handled. Files that interactively get
loaded while pulseview is running are not handled yet.

Installer: Add debug shortcut for -l 5

DecodeTrace: Use qreal instead of int for annotation drawing

This is to prevent "blinking" of annotations when they would merge into
blocks and break off of them again, noticeable when zooming in and out
using a track pad or touchscreen.

DecodeTrace: Speed up painting by not copying the annotations

Fix #1149 by handling "d" and "(dd)" types separately

Update property widgets before showing device config popup

DecodeSignal: Prevent out-of-range exception

DecodeSignal: Re-set decoder metadata after stack termination

LogicSegment: Readability changes

Fix bar displaying undecoded area

Issue #1: As decoding happens while the trace is drawn, the
annotations may actually overlap with the bar because the number
of decoded samples is outdated.

Issue #2: The bar is a little too low and off-center.

DecodeTrace: Remove unused members

DecodeSignal: When lacking input, retry only when data is available

Fix #1174 by performing shutdown speed optimizations

Don't use qDebug().noquote() for now (bug #1169)

Annotation: Use special type for the class, not plain int

Fix #1162 by always submitting all changed options to libsrd

Channels popup: Use a more compact one-line button row.

inputfile: Increase chunk size from 16KB to 4MB.

Use a 4MB chunk size for reading a file into memory. Larger values don't
seem to provide any substancial performance improvements, but can cause
UI lag and a visually "stuttering" display of the data currently loading.

inputfile: Use a vector instead of an array on the stack.

Increasing the chunk size could cause issues when trying to put
large arrays on the stack.

Fix #709 by deriving row/ann colors from the channel color

Trace: Remove unneeded setters

Channels: Add missing include

SignalBase: Don't assume all channel settings are restorable

Rename colour* to color*

Centralize session error notification

Fix #1153 by only showing drivers we'll actually scan

Channels: Break up logic and analog channels into separate grids

This way, a named analog channel (e.g. "SDA analog") won't visually disturb
the alignment of the logic channels if there are only ungrouped channels.

To see this change in effect, you may compare using sainsmart_dds120_powerup_scl_analog.sr

Channels: Let "Enable all changing" also check for sample data

Channels: Don't use flat buttons and add vertical spacer

With the buttons being flat, users may not recognize the labels as
buttons intuitively. Hence, make the buttons explicitly appear as
such. To make the dialog more aesthetically pleasing, we add some
vertical space between the check boxes and the buttons.

Channels: Re-arrange selector buttons

Session: Don't process packets without sample data

Fix #1023 by implementing filtering channel selectors

DecodeSignal: Use srd_session_terminate_reset() for multi-segment data

Apply option changes immediately, not on decode stack rebuild

Add DecodeSignal and Session error logging

Logging: Make logging thread-safe

Otherwise, we crash when two threads try to add entries to the log
at the same time.

view.cpp: Drop unneeded parenthesis.

Fix build with -DENABLE_DECODE=n.

Fix two clang-tidy warnings.

CMakeLists.txt: Set CMake policy CMP0054 to NEW.

This prevents the following warnings upon a second cmake run:

  CMake Warning (dev) at /usr/share/cmake-3.10/Modules/CMakePushCheckState.cmake:65 (if):
    Policy CMP0054 is not set: Only interpret if() arguments as variables or
    keywords when unquoted.  Run "cmake --help-policy CMP0054" for policy
    details.  Use the cmake_policy command to set the policy and suppress this
    warning.
    Quoted variables like "HAVE_CXX_ATOMICS_WITHOUT_LIB" will no longer be
    dereferenced when the policy is set to NEW.  Since the policy is not set
    the OLD behavior will be used.
  Call Stack (most recent call first):
    CMakeLists.txt:123 (cmake_push_check_state)
    CMakeLists.txt:139 (check_working_cxx_atomics)
  This warning is for project developers.  Use -Wno-dev to suppress it.

CMakeLists.txt: Set CMake policy CMP0071 to NEW.

This fixes bug #1143.

DecodeSignal: Re-create SRD session when changes are pending

DecodeSignal: Reset and re-use existing decoder sessions

Instead of destroying and re-creating decoder sessions, re-use
previously created sessions by just terminating their current work and
resetting internal state.

This implementation most proboably is incomplete in respect of changes
to the stack hierarchy or individual decoders' properties. This needs
more attention. When the stack is kept but its configuration has changed,
the involved properties need to get "somehow applied to" the stack's
instances before re-using it with new input data will yield correct results.

logging: Minor consistency fixes.

logging: Use different color for srd log messages.

The old brown color looked pretty reddish on some monitors (which
could be confused to mean "error"), select a slightly different color.

Session: Set "segment complete" flags when no frames are used

Without this, A2L conversion is skipped for segment sizes smaller
than ConversionBlockSize, e.g. when acquiring only 100 samples.

Really fix #1125 (and maybe #1139)

manpage: Mention -s | --log-to-stdout option.

GlobalSettings: Announce settings changes to allow logging

Settings: Change page list design

This may also fix #1095, we'll see.

Main: Create human-readable stack trace and notify user

Main: Add missing --no-scan long option for -D

Main: Add -s option to allow logging to console as before

SignalHandler: Rename include guard

Add logging mechanism

Add boost::stacktrace support

CMakeLists.txt: Fix a build issue on MSYS2.

Only apply an MXE-specific workaround on MXE (but not when building
natively using MSYS2), otherwise there are issues on MSYS2.

CMakeLists.txt: Only add Qt5PlatformSupport for Qt < 5.8.0.

Qt5PlatformSupport was removed in Qt 5.8.0.

fix catching polymorphic types by value

Compiling with GCC 8 produces a new warning about catching polymorphic
types by value. Proper way is to use references instead.

/home/sharkcz/projects/pulseview/main.cpp: In function ‘int main(int, char**)’:
/home/sharkcz/projects/pulseview/main.cpp:229:22: error: catching polymorphic type ‘class std::exception’ by value [-Werror=catch-value=]
   } catch (exception e) {
                      ^
cc1plus: all warnings being treated as errors

Fix #1128 by showing firmware and PD search paths in settings dialog

Apply changes suggested by clang-tidy

Fix #1125 by adding a missing typecast

Without this typecast, the return type of get_sample_count() is
a uint64_t, which doesn't go well when it's 0 and we subtract 1
from it. Assigning the result of this underflow to an int64_t
doesn't help, it's too late.

SignalBase: Speed up conversion and prevent leaving samples unconverted

Unconverted samples can happen due to a race condition: being notified
of new samples coming in is ignored when the thread is already executing.
If these notifications however were the last ones sent out because the
segment was completed right after, the currently ongoing conversion
will finish but not be restarted with the final sample range.

With this patch, this is prevented.

Adjust signal to changes made in 7f894d958

This one slipped through and needs adjustment.

MainBar: Style fixes

Fix #928 by catching errors if config_list() fails

MainBar::config_list() may fail so catch errors and don't segfault.
Discovered using an OLS with unknown firmware not supporting metadata.

Signed-off-by: Wolfram Sang <redacted>

Fix #1132 by passing segment IDs, not segment instances

Passing segment instances fails because this creates a race condition.
When a long conversion is taking place, the SignalBase::samples_added
signal is called often but since it's in a separate thread, the calls
are queued and aren't executed immediately. Now if the conversion is
restarted - for example as a result of a changed conversion threshold -
then the segments holding the converted data are destroyed, rendering
the pointers submitted as parameters to samples_added invalid.

Once the signal queue is processed, those invalid pointers will be
accessed and PV segfaults.

Since the signal queue can neither be emptied nor flushed, this
leaves only two sensible choices:
1) Signal samples_added less often, thereby reducing the chance of
signals being queued
2) Supply the segment ID instead of the segment instance as that's
essentially the only thing we currently care about - in fact, the
only user of samples_added (ViewBase::on_samples_added) uses the
instance to query only this

As #1 is only a band-aid and not a waterproof solution, I chose
to go with #2.

Session: Fix trigger handling

GlobalSettings: Remove unneeded include/using

Session: Add error messages

Tiny whitespace fix

Fix #1038 by catching invalid cursor ranges

MinGW: Fix a compile error due to a missing #include.

  In file included from [...]/pv/globalsettings.cpp:20:0:
  [...]/pv/globalsettings.hpp:31:12: error: 'std::function' has not been declared
   using std::function;
              ^
  test/CMakeFiles/pulseview-test.dir/build.make:88: recipe for target 'test/CMakeFiles/pulseview-test.dir/__/pv/globalsettings.cpp.obj' failed
  make[2]: *** [test/CMakeFiles/pulseview-test.dir/__/pv/globalsettings.cpp.obj] Error 1
  make[2]: *** Waiting for unfinished jobs....
  [  5%] Building CXX object CMakeFiles/pulseview.dir/pv/globalsettings.cpp.obj
  In file included from [...]/pv/globalsettings.cpp:20:0:
  [...]/pv/globalsettings.hpp:31:12: error: 'std::function' has not been declared
   using std::function;
              ^

Add #include <functional> everywhere where std::function is used. Only
the occurence in globalsettings.hpp was causing an actual build failure
on MinGW, though.

fix PulseView compilation with ENABLE_DECODE set to OFF

MainBar: fixup file extension filter in "Import File" dialog

The previous implementation used a "*" filter when a file of any other
format than srzip got imported. This happened to be a duplicate of
"All files", and ignored the list of filename extensions provided by
the input formats.

This change does respect the input format's file extensions, and copes
with the lack of such a list (raw binary), as well as lists that have
one (most formats), or multiple extensions (raw analog).

This fixes bug #1039.

Another byproduct of the change is that extensions and their decoration
(separators, parentheses) move outside of tr() calls. These technical
details shall not concern translators, and translations for human
languages shall not break the filter mechanism.

This implementation might be "too complex, computationally expensive".
But it works, and fixes an issue, and the code path executes seldom and
waits for user interaction anyway. Cost reduction can get applied later.

Fix #1089 by updating the signal labels and group labels

Group names currently don't change, so this doesn't do much
but they may change in the future, so it's useful to do anyway.

Ruler tick legends don't partly disappear when scrolled off the ends

Rework the callback mechanism for the global settings

Up to now, registered callbacks could not be unregistered
because std::function does not permit comparing for equality.

Using an interface class removes the need for std::function,
making the mechanism a little less elegant but at least fully
functional.

View: Fully integrate the "zero trigger time" setting

Session/View: Save triggers in a list and use it

Session: Clean up header a little

Adjust unit tests

Change the number of minor ticks to be either 4 or 5

Depends on the current tick interval size, in the sense of the 1, 2, 5
sequence. It was originally always 4.

Provide a settings checkbox for showing zero at the trigger

DecodeSignal: only pass non-zero sample rate to decoders

As reported in bug #1118 not all input sources provide a samplerate, and
decoder instances may not cope with a rate spec of 0. Only pass non-zero
sample rates to the decoder stack. This improves robustness in addition
to the specific fix for #1118 in the decoders' implementations.

doc: Update pulseview(1) manpage, add --no-scan option (-D)

main: introduce -D cmdline option, don't auto-scan for devices

Add a -D command line option which skips auto-detection of devices upon
startup. This can speedup program startup for setups with known devices,
and allows to skip the scan for troubled drivers which might break the
startup phase.

This -D option can be combined with -d specs, either presence or absence
of -d is acceptable when -D is specified. Users still can interactively
scan for and use devices after program startup.

This resolves bug #1116.

win32: Use -mwindows only for non-Debug targets.

Direct cmake to apply the -mwindows linker switch based on a cmake
command line argument rather than by using a patch file. The command
line argument is -DCMAKE_BUILD_TYPE=xxxxx and applies the linker switch
only to WIN32 builds that are not Debug.

DecodeSignal: Void a session pointer after destroy() call

Fixup an error path when starting a created decoder session fails.

main.cpp: check log level range before using its value

(Silently) ignore invalid -l loglevel specs. This avoids a crash
reported in bug #1071.

Fix unit tests

Add segment display mode UI controls and some related changes

Add segment display mode icons

Session: Make get_segment_count() consider all segments

Also changes the type for the getters to uint32_t.

Supply the segment ID when adding samples to optimize trace painting

Use case is as follows:
- Capture 20+ segments with ~500kS each
- Afterwards, enable conversion for a channel

Without this change, the converted logic will be repainted
20++ times because we are only told that new samples were
added but not which segment.

With this change, the logic trace is only painted when we
see that samples were added to the segment we're showing.

Add segment_id to all segment classes